"Es inadmisible cualquier enfrentamiento entre los iraquíes y las unidades de los peshmerga", dijo en una rueda de prensa organizada en el grupo mediático Rossiya Segodnya.
"En caso contrario, se generarán problemas difíciles de resolver", apuntó.
Hadi también descartó la posibilidad de un conflicto armado dentro de Irak.
"Estamos dispuestos a sentarnos a la mesa de negociaciones para discutir (con los kurdos) todas las discrepancias", destacó.
Subrayó que el Gobierno de Irak está dispuesto a seguir dialogando con el Kurdistan iraquí, pero sin considerar los resultados del referéndum de independencia.
Destacó que no existe bloqueo a la región y que "continúan los vuelos de Bagdad a Ebril, de Basra a Erbil, los automóviles pasan".
"Cuando hablan de un bloqueo, no es verdad, el pueblo kurdo es parte del pueblo iraquí, es parte de nuestro país", afirmó.
Al mismo tiempo el embajador reconoció que "fueron suspendidas durante un tiempo las comunicaciones con la región", pero subrayó que "esto se hizo conforme a la ley".
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"En cuanto se establezca un diálogo, los vuelos (desde Kurdistán a otros países) se reanudarán", dijo.
Anteriormente el primer ministro de Turquía, Binali Yildirim, afirmó que Ankara, Bagdad y Teherán están dispuestos a imponer nuevas sanciones contra el Kurdistán iraquí si las autoridades de la autonomía no suspenden los resultados del referéndum de independencia.
El 25 de septiembre el Kurdistán iraquí celebró una consulta no vinculante, en la que un 92% de los votantes apoyaron la independencia de la región.
Las autoridades de Irak calificaron la consulta popular de ilegítima y subrayaron que no reconocerán los resultados de la votación.
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El Parlamento autorizó al primer ministro iraquí Haider Abadi enviar tropas a la zona petrolera disputada de Kirkuk, ocupada por los kurdos en el marco de la lucha contra los terroristas de Daesh (autodenominado Estado Islámico, proscrito en Rusia y otros países).
Por su parte, Kirkuk, que también participó en el referéndum independentista, declaró que la provincia no obedece a Bagdad ni permitirá la entrada de las fuerzas iraquíes.