El terremoto de magnitud 4,4, cuyo epicentro se situó a solo cuatro kilómetros bajo la superficie, ocurrió a las 13:28 (6:28 GMT) hora local a medio centenar de kilómetros al norte de Kebumen.
Según el informe preliminar publicado por BNPB anoche, el seísmo mató a dos personas, además de causar 21 heridos y provocar daños a 316 casas.
Más de 2.100 residentes de la zona fueron evacuados.
El jefe de BNPB en Java Central, Sarwo Praman, citado por AP, afirmó entretanto que las víctimas mortales son tres: dos ancianos y un adolescente que fueron aplastados por los escombros.