Ahora las unidades del caza T-50 están dotadas de motores AL-41F1, la versión modernizada del propulsor AL-31 del caza Su-27. La diferencia principal es el empuje aumentado: 15 toneladas en vez de 12,5. Además, los motores pueden volar durante 4000 horas consecutivas sin necesidad de mantenimiento en vez de 1000 en la versión más antigua.
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En el AL-41 por primera vez fue implementado el sistema de encendido de plasma, gracias al que se hizo posible el arranque sin oxígeno. El sistema de manejo es completamente automático. En caso de un fallo, por ejemplo, a raíz de una explosión nuclear, el regulador centrífugo del caza puede permitir que la aeronave regrese a la base.