"Todos han de saber que la crisis siria no tiene una solución militar", dijo al reunirse con la jefa de la diplomacia europea, Federica Mogherini.
El presidente iraní destacó que el terrorismo es "una amenaza enorme a todo el mundo".
Rohani indicó que la lucha contra el terrorismo en Siria e Irak debe ser prioritaria.
"Si no luchamos contra el terrorismo en la región con toda la seriedad, en el futuro observaremos unos Estados terroristas en la región y en el norte de África, en este caso la lucha contra ellos será muy difícil", advirtió.
Rohani además llamó a los países de la UE a influir en los países que patrocinan el terrorismo.
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Mogherini a su vez destacó el papel crucial de Irán en la resolución de problemas regionales.