"Es un asunto que concierne íntegramente a los sirios", dijo Bogdánov al contestar a una pregunta sobre este tema.
El diplomático desveló que los acuerdos tampoco abordan el proceso de transición.
Bogdánov llamó a todos los países, al Gobierno sirio y a la oposición a leer otra vez la resolución 2254 del Consejo de Seguridad de la ONU.
"Esta resolución habla claramente no solo sobre el alto el fuego, la seguridad, la lucha contra el terrorismo y la ayuda humanitaria a la población, sino también sobre el proceso político en Siria", apuntó.
Plan secreto
El vicecanciller declaró que Moscú no tiene plan secreto alguno para poner fin al conflicto en Siria.
"A diferencia de las declaraciones públicas de algunos representantes occidentales y árabes de que tienen un plan B, siempre hemos sostenido que no tenemos ningún plan B ni C secreto", dijo.
Destacó que "lo que se acordó en Viena, Nueva York y en el Consejo de Seguridad de la ONU es el único plan que apoyamos y llamamos a otros a cumplir los compromisos derivados de esos documentos de consenso internacionales".
Actualmente Rusia está negociando con EEUU desvelar en el Consejo de Seguridad de la ONU detalles de sus acuerdos sobre Siria alcanzados el 9 de septiembre.
"Ahora estamos tratando este tema con nuestros socios estadounidenses", dijo Bogdánov.
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Agregó que "a nuestro juicio, la idea de buscar apoyo del Consejo de Seguridad para estos acuerdos es buena, pero no sería correcto pedir a los socios que respalden lo que no conocen".
Oposición
"Esperamos de nuestros socios estadounidenses una discusión y un trabajo contundente con estos opositores irreconciliables, ya que su postura no llevará a la paz en Siria", indicó el diplomatico ruso.
Bogdánov denunció que al declarar que no van a apoyar la tregua estos grupos opositores "de hecho respaldan a los terroristas".
El ministro ruso de Exteriores, Serguéi Lavrov, acordó el 14 de septiembre con su homólogo estadounidense, John Kerry, prorrogar por 48 horas el armisticio de dos días que entró en vigor el lunes, 12 de septimbre, en Siria.
El pacto que Moscú y Washington consiguieron la semana pasada en Ginebra, establece que los dos países deben comenzar a coordinar los ataques contra el Frente al Nusra (actual Fatah al Sham) y Daesh (autoproclamado Estado Islámico), proscritos en Rusia y varios países más, así como otras facciones terroristas en Siria al concluir una tregua de siete días.
Diálogo inclusivo
"Opinamos que todos estos acuerdos deben estimular de una manera muy seria el inicio de un proceso político estable, amplio e inclusivo con la participación de todas las fuerzas sirias pro- y antigubernamentales", recalcó Bogdánov.
El diplomático indicó que por ahora no está claro si los kurdos participarán en las negociaciones sirias en Ginebra.
"Es demasiado fuerte la presión de algunos miembros del Grupo que consideran al Partido de la Unión Democrática (PYD) kurdo como cómplice de los terroristas o como 'un elemento que sobra' ya que en Ginebra ya están presentes los delegados kurdos de otras formaciones políticas".
Rusia en reiteradas ocasiones insistió que las consultas sirias deben contar también con la participación de los kurdos, una de las partes influyentes del conflicto en el país árabe, planteamiento al que se opone categóricamente Turquía.
Bogdánov advitió que la ausencia del opositor Alto Comité de Negociaciones (ACN) en las consultas sirias perjudicará el resultado del diálogo.
"La ausencia de la delegación del ACN en una nueva ronda del diálogo sirio tendrá una repercusión directa en su resultado", dijo a Sputnik.
Especificó que "la pausa (en celebrar la nueva ronda de las negociaciones sirias) ante todo se debe a que el ACN (Alto Comité de Negociaciones) viola continuamente el principio de no plantear las condiciones preliminares para llevar a cabo contactos con el Damasco oficial".
Previamente, el ACN indicó que participará en las negociaciones con el Gobierno sirio solo si hay garantías de su éxito.
Anteriormente, Bogdánov comunicó a RIA Novosti que las negociaciones entre el Gobierno y la oposición de Siria pueden volver a celebrarse a principios de octubre.
La última ronda de las negociaciones sirias en Ginebra se celebró en abril pasado sin que se lograra establecer el diálogo directo entre Damasco y los representantes de la oposición.