Choudary está imputado junto a otro ciudadano británico, Mohammed Rahman, de incitación al terrorismo entre el 29 de junio de 2014 y el 6 de marzo de 2015.
La Fiscalía los acusa de promocionar al EI en "discursos individuales que luego fueron publicados en internet".
De familia pakistaní y cuna londinense, Choudary es notorio por su defensa del yihadismo y la instauración de la ley islámica en Reino Unido.
La prensa conservadora inglesa relaciona al clérigo con el reclutamiento y adiestramiento militar de musulmanes en Inglaterra antes de partir a hacer la yihad (guerra santa).
Opuesto a las guerras de Irak y Afganistán, Choudary se negó a condenar públicamente los atentados islamistas en el transporte público de Londres de 2005.
"El proceso penal ha comenzado y ambos individuos tienen derecho a un juicio justo", destacó Sue Hemming, responsable fiscal en contraterrorismo, en un comunicado difundido hoy.