La crisis por la cual pasa la compañía, que debe cerca de 30 millones de dólares a las autoridades fiscales mexicanas, ha empeorado con la cancelación de todos los vuelos internacionales y la drástica reducción en el tráfico nacional debido al coronavirus. Como resultado, 59 de los 66 aviones Airbus de la flota de Interjet han sido puestos en tierra por la baja cantidad de vuelos y por conflictos con los arrendadores. Las siete aeronaves de Airbus restantes se encuentran en mantenimiento y serán recuperadas por los arrendadores después de pasar por reparaciones.
En distintas ocasiones, los medios mexicanos han apuntado que la flota de Superjets de la aerolínea estaría inactiva debido a supuestas dificultades con el servicio proporcionado por su fabricante. El noviembre pasado, sin embargo, VEB, el mayor banco de fomento de Rusia, informó que analiza participar en la apertura de un centro de mantenimiento en México para los aviones Superjet 100.
El Superjet 100, o SSJ-100, es un avión de pasajeros para vuelos de corta distancia, diseñado para transportar hasta 98 pasajeros. El avión realizó su primer vuelo en mayo de 2008 y entró en una operación comercial en 2011. Hasta la fecha, se han producido cerca de 200 unidades.