"Están acusados de haber asesinado a más de 300 serbios, en su mayoría civiles, principalmente ancianos, así como prisioneros de guerra, incluidos los que se entregaron voluntariamente", dijo el portavoz de la Fiscalía, Boris Grubesic.
Los cargos incluyen también datos sobre la destrucción de 38 iglesias ortodoxas, capillas y otras instalaciones religiosas.
Dudakovic fue detenido a finales de abril.
En la década de los 90 estuvo al mando del quinto cuerpo del Ejército de la musulmana República de Bosnia y Herzegovina, que operó en la entonces provincia de Bosnia Occidental.
En 1992 Bosnia y Herzegovina salió de Yugoslavia, tras lo cual se desencadenó una guerra entre musulmanes bosnios, serbios y croatas que duró hasta 1995 y que, según distintas fuentes, causó más de 100.000 muertos.
Radio: Yugoslavia: su caída fue más un botín político que una crisis étnico-cultural
El 21 de noviembre de 1995 se firmaron los Acuerdos de Dayton que proclamaron la Federación de Bosnia Herzegovina, la República Srpska y el distrito especial de Brcko y establecieron la representación de las tres naciones en una Presidencia con tres miembros, que sustituye al presidente y a los órganos de poder habituales.