Esta designación fue rechazada por el Ejecutivo catalán como una violación de sus competencias en materia de seguridad.
El coronel Pérez de los Cobos fue la persona designada por la Fiscalía Superior de Cataluña para coordinar a los tres cuerpos implicados en el dispositivo policial desplegado con motivo del referéndum de autodeterminación del 1 de octubre, que es considerado ilegal por el Tribunal Constitucional español.
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El nombramiento de un mando de un cuerpo militar de ámbito nacional como la Guardia Civil para la coordinación de un cuerpo dependiente del Gobierno catalán como los Mossos d'Esquadra fue calificado como una "injerencia" el pasado 23 de septiembre por Joaquim Forn, consejero de Interior catalán
Posteriormente, según publicó El Periódico de Cataluña, Trapero envió una nota interna a sus agentes en la que criticaba la tutela de mandos policiales dependientes del Ministerio de Interior pero adelantaba que no tenía intención de desobedecer.
Fuentes de la policía autonómica catalana aseguraron a Sputnik que los Mossos d'Esquadra enviarán representación a la reunión convocada para esta tarde, aunque no avanzaron si esta será de máximo nivel.
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El portavoz del Gobierno catalán, Jordi Turull, reitró el rechazo de su Ejecutivo al nombramiento de un mando de único español ya que, a su modo de ver, en Cataluña "la coordinación máxima es de los Mossos d'Esquadra".
La polémica designación de un mando único para el dispositivo en Cataluña toma su base en el el artículo 46 de la Ley Orgánica que regula el funcionamiento de las Fuerzas y Cuerpos de Seguridad en España.
De acuerdo a esa norma, cuando "en la prestación de un determinado servicio o en la realización de una actuación concreta concurran, simultáneamente, miembros o Unidades de las Fuerzas y Cuerpos de Seguridad del Estado y de la Policía de la Comunidad Autónoma, serán los Mandos de los primeros los que asuman la dirección de la operación".
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El Gobierno catalán, en cambio, discrepa de esa interpretación de la ley y, según comunicó Forn durante la tarde del sábado, se encuentra trabajando para ofrecer una "respuesta jurídica" contra esta decisión.