El Gobierno "irá a fondo en la investigación y sin protección para nadie", señaló Peña en un comunicado de Presidencia.
La comunidad fue reprimida con balas de plomo mientras realizaban un corte de carretera en las inmediaciones de unas tierras entregadas a la multinacional Benetton.
En alusión a las marchas en las que participaron centenares de miles de personas a lo largo del país para reclamar la aparición con vida del joven, el funcionario aseguró que el reclamo era "absolutamente legítimo" y por lo tanto "lo acompañamos todos".
"No vamos a permitir ningún tipo de encubrimiento, vamos a ir a fondo con la investigación y esperamos que la justicia pueda avanzar en todos los elementos que estén dando vueltas", afirmó el jefe de gabinete.
"Si se comprueba cualquier hecho ilegal, seremos los primeros en ser muy duros", aseguró Peña.
Pero el Ejecutivo no avanzará sobre la fuerza federal cuestionada, "que trabaja para combatir el narcotráfico, cuida las fronteras, que trabaja en muchos barrios", matizó el jefe de Gabinete.
Incidentes en Buenos Aires
Como consecuencia de los disturbios, 30 personas fueron detenidas, las cuales serán indagadas por los delitos de "intimidación pública, atentado y resistencia a la autoridad".
Macos Peña manifestó que "lo primero de todo es el repudio y el rechazo a la violencia, sea de quien sea".
"Cuando se tiñe políticamente, la violencia siempre es mala, pero no escuchamos esta condena a la violencia que tenemos que tener todos los sectores políticos", consideró.
En una rueda de prensa, la Coordinadora de Acción contra la Represión Policial e Institucional (Correpi) denunció que los arrestados no pudieron ser visitados por sus familiares ni por sus abogados, y que se encuentran incomunicados por decisión del juez federal Martínez de Giorgi, a cargo de la investigación.