El 9 de marzo de 1953, Stalin se quedó en el mausoleo para siempre, pero ocho años más tarde, la noche del 31 de octubre al 1 noviembre de 1961, sus restos dejaron de descansar allí. En ese mismo momento, en el mundo occidental se celebraba Halloween.
En el último día de encuentros, Iván Spiridónov, primer secretario de la sección regional del PCUS en Leningrado —hoy San Petersburgo— propuso "mover los restos de Stalin del mausoleo". La idea fue secundada por su homólogo en Moscú, Piotr Démichev.
Votaron unánimemente: "No se considera conveniente prolongar la conservación del sarcófago con el ataúd de Stalin en el mausoleo. Graves violaciones de los preceptos de Lenin, abuso de poder, represiones masivas contra el pueblo soviético honesto y otras actividades en el período de culto a la personalidad hacen que sea imposible dejar el ataúd con el cuerpo [de Stalin] en el Mausoleo de Lenin".
El mausoleo fue previamente rodeado con tableros de madera contrachapada. Ocho oficiales del regimiento del Kremlin cambiaron el sarcófago por un ataúd de madera. Después, el cuerpo fue trasladado al laboratorio del mausoleo, donde del uniforme de Stalin cortaron las charreteras de mariscal, sus órdenes y los botones de oro. Paralelamente, los soldados habían cavado una fosa al lado del muro de Kremlin. La inscripción en el mausoleo de 'Lenin Stalin' fue cambiada por 'Lenin' a secas.
"Jruschov tenía un solo objetivo: terminar con Stalin. Y lo perseguía por todos los medios. Pero sin querer hizo una buena cosa enterrando a Stalin mientras Lenin seguía en el mausoleo", declaró en una entrevista un participante en el entierro, el exsoldado del regimiento de Kremlin Nikolái Berlev.
Otros consideran que la Unión Soviética ya no necesitaba a un líder como Stalin: "Perturbaba a la gente, puesto que constantemente los obligaba a pensar en la seguridad personal. Restringía su apetito manteniéndolos casi todo el día en el lugar de trabajo".
Un tercer grupo aún cree que Jruschov podía haber mostrado simpatía común y corriente hacia las personas represaliadas que estaban volviendo de los campos de trabajo donde habían sido enviados por Stalin.