La renuncia fue aceptada con 116 votos favorables, mientras 42 legisladores estaban ausentes.
"En caso de falta temporal o absoluta del presidente de la República, lo sustituirá el vicepresidente. Si la falta fuere absoluta, el vicepresidente desempeñará la Presidencia hasta la terminación del período constitucional", establece el artículo 189 de la Constitución Política de Guatemala.
Maldonado no realizó declaraciones a los medios locales, pero en caso de no aceptar el cargo, el Congreso deberá elegir a un sustituto, según el artículo 192, que presidirá el país hasta enero de 2016, cuando asuma el cargo el nuevo mandatario elegido por la ciudadanía en las elecciones previstas para este domingo.
La carta renuncia de Pérez Molina ingresó al Congreso a las 23:58 (hora local) del miércoles.
El Ministerio Público guatemalteco había pedido la captura de Pérez Molina luego de que el Congreso le quitara su inmunidad por su presunta participación en una estructura para cometer fraude aduanero conocida como La Línea.