El encuentro, que duró cerca de media hora, se centró en el asunto de los ciudadanos nipones capturados por los servicios secretos norcoreanos en los años 1970 y 1980 y aún retenidos en el país comunista, según la cadena NHK.
Los dos cancilleres también abordaron el tema de los programas nuclear y balístico de Pyongyang, informa el medio sin ofrecer más detalles de la reunión.
El año pasado, Corea del Norte se comprometió a investigar la suerte de los japoneses capturados, a lo que Tokio respondió levantando parte de las sanciones económicas contra el país comunista.
Aunque la investigación tenía que haber finalizado en un año, Pyongyang no ha presentado hasta ahora ni siquiera un informe preliminar.
A principios del pasado mes, el Gobierno norcoreano pidió ampliar el plazo de la investigación, y Japón urgió a su vez a que se presente un informe de la investigación realizada.