La muerte ocurrió hace dos o tres días, según comunicaron fuentes del Gobierno e Inteligencia afganas.
No se comunica la causa de la muerte.
El portavoz del grupo declaró que pronto hará un anuncio público al respecto.
Con Omar al frente, el grupo Talibán logró la victoria sobre las milicias afganas rivales en la guerra civil que se desató tras la retirada de las tropas soviéticas del país.
Su alianza con el líder de Al Qaeda, Osama bin Laden, llevó a la invasión estadounidense en Afganistán en 2001, tras los atentados 9/11 en Nueva York y Washington.