Los enfrentamientos entre los rebeldes y las fuerzas de seguridad nigerianas, según la agencia, se produjeron en el estado de Borno, en el noreste de Nigeria.
Las pérdidas entre los militares se cifran en dos muertos y otros diez heridos, también unos guerrilleros fueron tomados en cautiverio.
Boko Haram es un grupo islamista suní que libra una guerra insurgente con el fin de establecer un Estado de corte islámico en el noreste de Nigeria y que está detrás de la mayoría de los atentados que se cometen en el país.
Opera también en el norte de Camerún atacando pueblos, robando y tomando rehenes.
Los ataques de Boko Haram han causado más de 13.000 muertos en cinco años y han obligado a 1,5 millones de personas a dejar sus hogares.
El año pasado, el líder nigeriano, Goodluck Jonathan, declaró el estado de emergencia en varios estados del país a raíz de la amenaza terrorista.