La petición de amparo fue presentada ante el juez Octavo de Distrito en materias de Amparo y Juicios Federales en el Estado de México. El recurso aún no se admite a trámite, debido a que el magistrado concedió un plazo de cinco días al abogado de Zerón para certificar el poder notarial que se otorgó a su favor, así como para aclarar el domicilio del solicitante.
En 2016, el Grupo Interdisciplinario de Expertos Independientes difundió un vídeo donde se observa a Tomás Zerón en el río San Juan, en el municipio de Cocula, en una diligencia con Agustín García Reyes, El Chereje, sicario de Guerreros Unidos, sospechoso de participar en la desaparición de los normalistas.
Asimismo, en la investigación de los expertos internacionales se sugiere que el 28 de octubre de 2014, un día antes de que se hallaran dos bolsas de plástico con restos óseos quemados en el río, pudo ocurrir una manipulación de pruebas.
Zerón justificó que su presencia en el río San Juan en esa fecha fue legal y que su recorrido fue por la orilla del río, donde fue acompañado por personal de la extinta Procuraduría General de la República (PGR).