El organismo señala que el Ministerio de Sanidad se ha negado a proporcionar información pública sobre temas relacionados con la pandemia. Según el diario El País, de 17 resoluciones analizadas por este organismo respecto a peticiones hechas a Sanidad desde el mes de marzo, quince de ellas no han recibido respuesta alguna.
Según esta denuncia, otro de los temas que Sanidad no ha respondido al Consejo de Transparencia y Buen Gobierno tienen que ver con las reuniones mantenidas por el ministro de esta cartera, Salvador Illa, y los encuentros y reuniones que ha sostenido el director del Centro de Coordinación de Alertas y Emergencias Sanitarias (CCAES), Fernando Simón. Tampoco habrían dado respuesta a solicitudes relacionadas con la compra de material sanitario, informes o protocolos sobre cuándo pueden saltarse la cuarentena miembros del Gobierno, actas de reuniones de comités creados para luchar contra la pandemia e información estadística sobre el coronavirus.
El Consejo de Transparencia, que fue creado en 2015 y, aunque es independiente en sus juicios, depende orgánicamente del Ministerio de Política Territorial y Función Pública, lamenta que desde Sanidad se esté "dificultando la adecuada protección y garantía del derecho constitucional a acceder a la información pública".
Desde el 15 de marzo de 2020 se congeló por varios meses la aplicación de la Ley de Transparencia. Las peticiones se empezaron a tramitar a partir del 1 de junio, unas tres semanas antes de finalizar el estado de alarma.