Su único rival, Soumaila Cisse, de la opositora Unión por la República y la Democracia obtuvo el 32,83% de los votos, informa el portal MaliJet citando al Ministerio de Administración Territorial.
La afluencia a las urnas fue el 34,54%.
Cisse calificó de falsificadas los resultados de la votación ya antes de que fueran anunciadas.
Keita, al frente del Estado desde 2013, volverá a jurar el cargo el 4 de septiembre.
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Con el resultado de las elecciones actuales, los 18 millones de malienses aspiran al cese del conflicto entre las fuerzas del Gobierno y los radicales, así como a la solución de graves problemas humanitarios y el resurgimiento de la economía.