"Saludamos la decisión del Gobierno español de dejar que el Aquarius desembarque en Valencia por razones humanitarias", dijo Avramopoulos en un mensaje publicado en Twitter.
El comisario europeo de Migración calificó la decisión de Madrid como un acto de "verdadera solidaridad".
"Esto es la puesta en práctica de verdadera solidaridad hacia esa desesperada y vulnerable gente y hacia los Estados integrantes de la Unión Europea", añadió Avramopoulos.
"Nos alivia que estas 629 personas sean acogidas en nuestro país", dijo Javier Martos, director ejecutivo de Unicef Comité Español, según consta en un comunicado difundido por la organización.
En esa nota, Unicef destaca que en el barco viajan 123 niños solos o no acompañados, que son "especialmente vulnerables a la trata de seres humanos y la explotación sexual".
"No debemos dejar que Europa se deshumanice y cierre los ojos ante una realidad de la que nos separan escasos kilómetros", prosigue la nota, que pone especial hincapié en que "tener a la deriva a estas personas incumple los mínimos estándares de derechos humanos y asistencia humanitaria.
Además, Unicef aprovechó la ocasión para recordar que España, al igual que la mayoría de sus socios europeo, lleva tiempo "incumpliendo muchos de los compromisos alcanzados en materia de refugiados y migrantes".
"No se están utilizando los mecanismos previstos para reasentar o reubicar a niños en condiciones de seguridad, y tampoco se están facilitando nuevas vías legales y seguras que impidan que se sigan perdiendo vidas en el mar", señala la organización.
Según Médicos Sin Fronteras, esa situación ponía en peligro a los migrantes a bordo, sobre todo a las siete mujeres embarazadas que fueron rescatadas y a 15 personas que presentaban quemaduras químicas graves provocadas por la mezcla de combustible y agua salada.
Además, personas presentaban un cuadro de ahogamiento crítico e hipotermia en el momento del rescate.
El Gobierno de España destacó que la acogida del barco es una "obligación" y que servirá para "evitar una catástrofe humanitaria"
El primer ministro maltés, Joseph Muscat, agradeció a España su actuación y acusó a Italia de crear una situación de caos en el Mediterráneo al "romper las normas internacionales".
Además: La ONU llama a promover imagen positiva de los inmigrantes
Joseph Muscat anunció que las autoridades de Malta dotarán al barco de rescate de los suministros necesarios para poder afrontar su viaje hacia España.